Candida species

Candida (phylum Ascomycota) are yeasts that often live harmlessly as part of the body’s natural flora but can cause disease if they enter sterile sites (e.g. bloodstream, eyes) or overgrow on mucosa (e.g. oral thrush, VVC). Identification and susceptibility testing are crucial in order to select an antifungal that will be effective. In part this is because different species have varying ability to form biofilms on indwelling devices that form a barrier to penetration of antifungals (Cavalheiro & Teixeira, 2018).

In recent years Candida auris has emerged as a cause of healthcare-associated bloodstream infections, which can be challenging to identify and is resistant to fluconazole. Report cases or get help with identification and infection control at CDC.gov. Read more about MALDI-ToF detection (Vatanshenassan et al, 2019), infection control (Caceres et al, 2019) or a review (Jeffery-Smith et al, 2018).

Many alternative therapists promote the ‘Candida diet’ as a cure for nonspecific symptoms such as fatigue, headaches and brain fog, but this is not supported by science. The diet is likely to make patients feel healthier as it is low in processed foods such as sugar and refined flour, rather than any effect on the growth of yeast in the gut. Read more at the Mayo Clinic

Conferencias y videos

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Folleto informativo

Candida albicans

Género y Especie
Candida albicans

Teleomorfo: No tiene
Sinónimo: Candida stellatoidea   (consultar la revisión de Neil Gow)
Hábitat natural
Es parte de la flora habitual de las membranas mucosas y el tracto digestivo del ser humano y animales. Cuando se aísla del medio ambiente suele reflejar contaminación por excretas de humanos o animales.
Distribución geográfica
Mundial.
Frecuencia
Es la causa más frecuente de todas las formas invasoras y sistémicas de candidosis.
Enfermedades
Es causante de la mayor variedad y número de las enfermedadess producidas por levaduras, desde infecciones superficiales, hasta sistémicas y diseminadas, como por ejemplo, onicomicosis, vaginitis, candidosis oral y esofágica, candidemia, infecciones diseminadas que afectan a cualquier órgano como el hígado, riñón, pulmón, etc., meningitis, endocarditis, pericarditis, peritonitis, artritis, osteomielitis, endoftalmitis, etc. Las infecciones profundas y diseminadas son más frecuentes en pacientes inmunocomprometidos. Además, causa la candidosis crónica mucocutánea en pacientes con un desorden genético de las células T.
Peculiaridades del cultivo
Las colonias son de color crema, brillantes, a veces céreas. La apariencia de la colonia es blanda y la superficie es lisa aunque a veces puede estar arrugada con un borde en el que se aprecia la forma micelial.

Como Candida dubliniensis, una especie muy cercana, forma hifas en medios de cultivo líquidos con suero que es la base de la técnica de identificación denominada “tubos germinales”. Tiene capacidad de formar biopelículas y pueden aparearse. El apareamiento requiere un cambio entre colonias blancas y opacas. Las colonias blancas son redondas, brillantes y con forma de joroba mientras que las opacas son alargadas, oscuras y mas aplanadas.
Resistencia a los antifúngicos (intrínseca y adquirida)
La mayoría de los aislados son completamente sensibles a todos los antifúngicos. La resistencia a la anfotericina B es muy rara. Por el contrario, la resistencia al fluconazol y otros azoles puede llegar hasta el 7% de los aislados salvajes. De los pacientes con SIDA que toman fluconazol de forma intermitente o a bajas dosis, se aíslan mas cepas resistentes a los azoles. Tras la exposición a la fluorocitosina se pueden aislar cepas resistentes. La resistencia a las equinocandinas es rara y se asocia a un tratamiento prolongado.
Utilización industrial
Se puede utilizar para retirar los tintes textiles antes de su eliminación industrial. Una cepa, denominada TL3 degrada compuestos fenólicos y formaldehido (Tsai et al, 2005)
Bioseguridad: Nivel 2
Esta especie se puede manejar en un laboratorio que cumpla las normas de biocontención del nivel 2.

Candida auris

Specie/nombre común
Candida auris. C. auris está filogenéticamente relacionada con Candida haemulonii and Candida ruelliae. Previamente, se ha identificado erróneamente como Candida duobushaemuloniiC. haemulonii, C. famata, C. krusei, C. lusitaniaeC. sakeSaccharomyces spp, Rhodotorula glutinis Kodamaea ohmeri con los siguientes sistemas comerciales de identificación: Vitek 2 y bioMérieux Industry API®/ID32.ú

El centro estadounidense para el control y prevención de las enfermedades (CDC) recomienda hacer más pruebas para descartar que no se trata de C. auris, cuando la levadura estudiada se identifica como C. haemulonii. Asimismo, es importante valorar el método de identificación utilizado y la especie que éste ha reportado. Se consigue una identificación exacta con VITEK MS y con Bruker Biotyper MALDI-TOF utilizando la base de datos denominada “research use only”. La secuenciación de la zona D1–D2 del 28s rDNA también identifica adecuadamente C. auris.

La cepa tipo de Candida auris sp. nov. es JCM15448T= CBS10913T= DSM21092T.
Hábitat natural
De momento no se ha encontrado el reservorio ambiental. Un porcentaje elevado de genes en C. auris están relacionados con el metabolismo central, una propiedad común en las especies de Candida spp. patógenas, ya que éstos son cruciales para su adaptación a diferentes situaciones.
Geographia
En 3 continentes se han identificado 4 clados distintos de aislados clínicos pertenecientes a áreas geográficas diferentes, lo que sugiere una aparición reciente y casi simultánea de diferentes poblaciones clonales. Se han encontrado varios grupos geográficamente relacionados en Corea del Sur, India, Sudáfrica, Pakistán, y en hospitales de Latinoamérica. La clonalidad en C. auris se ha estudiado con AFLP, multilocus sequence typing, y MALDI-TOF MS en las cepas de India, Sudáfrica, y Brasil. La secuenciación de próxima generación (NGS) ha demostrado una elevada proximidad entre las cepas de C. auris de 4 hospitales indios geográficamente separados lo que sugiere que cada clado tiene una diversidad baja.
Frecuencia
Candida auris es un patógeno emergente que se aisló por primera vez en 2009 en un exudado ótico de un paciente en Japón. Recientemente se ha asociado con candidemia e infecciones de heridas. En solo 7 años, esta levadura se ha distribuido por diferentes hospitales de numerosos países causando una amplia variedad de infecciones hospitalarias graves. El aumento del número de aislados de C. auris obtenidos de muestras clínicas diferentes indica claramente su habilidad para colonizar, invadir y causar infecciones de diferente gravedad.
Infecciones
Candida auris causa candidemia, infecciones de heridas y otitis Se ha aislado también de orina y del tracto respiratorio, sin embargo, es difícil delimitar si en estos dos precisos escenarios se trata de colonización o infección.

C. auris se ha aislado en sangre, catéter, LCR, hueso, secreciones óticas, líquido pancreático, pericárdico, peritoneal, pleural, secreciones respiratorias (incluyendo esputo y lavado broncoalveolar), piel, tejidos blandos, orina y secreciones vaginales. Se ha implicado como agente etiológico de candidemia, ventriculitis, osteomielitis, otitis maligna, otomastoiditis, infección intrabdominal, pericarditis, infección pleural, y vulvovaginitis. Como ocurre con otras especies de Candida no hay certeza de que cause infecciones respiratorias, urinarias, cutáneas y de tejidos blandos, a pesar de que se ha aislado de esas zonas.
La mortalidad atribuida a la candidemia causada por C. auris oscila entre el 28% y 66%.
Peculiaridadies del cultivo
Microscópicamente C. auris, es indistinguible de muchas otras especies de Candida. C. auris crece entre 37–42°C formando colonias de color rosa pálido en agares cromogénicos. Se ha conseguido diferenciar C. auris del complejo C. haemulonii con CHROMagar Candida suplementado con medio de Pal.  A diferencia de C. haemuloniiC. auris no forma seudohifas, aunque algunas cepas logran hacerlo de forma rudimentaria en agar maíz. C. auris produce biopelículas y se adhiere a los catéteres, aunque en menor cantidad que Candida albicans.
IDENTIFICATION
C. auris is phylogenetically related to Candida haemulonii and Candida ruelliae. Previously and currently mis-identified as Candida duobushaemuloniiC. haemulonii, C. famata, C. krusei, C. lusitaniaeC. sakeSaccharomyces spp., Rhodotorula glutinis  or Kodamaea ohmeri by commercial identification systems, such as Vitek 2 and bioMérieux Industry API®/ID32.
The CDC recommends further testing for C. auris whenever C. haemulonii is identified or in a number of other scenarios depending on the organism reported and the method of identification. Accurate identification can be performed with VITEK MS and Bruker Biotyper matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-ToF) devices using their ‘research use only’ databases.
More information on the CDC website
Molecular sequencing of the D1–D2 domain of the 28S ribosomal DNA can also identify C. auris.
Download the PCR protocol
In the U.S., all confirmed isolates of C. auris should be reported to local and state public health officials and CDC at candidaauris@cdc.gov
Resistancia a los antifúngicos (intrínseca y adquirida)
Casi todas las cepas de C. auris son resistentes al fluconazol y muchas a la anfotericina B, voriconazol, equinocandinas y 5-fluorocitosina.

No hay puntos de corte definidos por “Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) ” o “European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST)”. Las concentraciones mínimas inhibitorias (CMIs) de fluconazol son elevadas. El punto de corte tentativo es ≥32 mg/L. En 4 estudios, la CMI50 está entre 64 y 128 mg/L y la CMI90 entre 64y 256 mg/L utilizando la técnica de microdilución del CLSI. Las equinocandinas (el punto de corte tentativo para la anidulafungina y micafungina es ≥4 y para la caspofungina es ≥2) parecen ser más activas, con resultados más favorable para la anidulafungina (CMI50 intervalo 0,125–0,5; CMI90 intervalo 0,5–1), caspofungina (CMI50 0,25–0,5; MIC90 1), and micafungina (MIC50 0,125–0,25; MIC90 0,25–2). Los intervalos de las CMIs de anfotericina B (Punto de corte tentativo ≥2) son más amplios (CMI50 0,5–1; CMI90 2–4) y probablemente no sea muy adecuada su utilización como tratamiento empírico. Los resultados que se obtienen con la metodología EUCAST son similares a los del CLSI. Sin embargo, los resultados que se obtienen con Etest y Vitek deben ser interpretados con cautela hasta que haya más información.
Uso industrial 
Ninguno
Nivel de Bioseguridad 2
Candida auris colonies on agar (picture courtesy of the Centers for Disease Control and Prevention)

Candida glabrata

Género y especie
Candida glabrata (nombre antiguo: Torulopsis glabrata)

Teleomorfo
Ninguno
Hábitat natural
Es un saprofito de la especie humana. También se ha encontrado en la levadura del pan, larvas de las polillas de la madera, madera de abedul, zumo de naranja y de fruta de la pasión.
Distribución geográfica
Mundial.
Frecuencia
Dependiendo de la zona geográfica, Candida glabrata es la segunda causa más frecuente de candidosis mucosa (especialmente de vaginitis tras muchos cursos de tratamientos con azoles). También es una causa frecuente de candidemia e infección invasora.
Enfermedades
Es la segunda causa más frecuente de vaginitis por levaduras. Se aísla con frecuencia en pacientes con SIDA y candidosis orofaríngea o esofágica. También en casos de candidemia e infección urinaria. Es capaz de producir infecciones profundas y diseminadas especialmente en pacientes inmunocomprometidos. Produce biopelículas.
Peculiaridades del cultivo
En el medio de cultivo, las colonias son de color crema, con apariencia blanda. La superficie es lisa y brillante. No produce ni hifas, ni seudohifas, ni clamidosporas. Se reproduce solo por gemación.
Resistencia a los antifúngicos (intrínseca y adquirida)
La mayoría de las cepas son sensibles a la anfotericina B, fluorocitosina y equinocandinas. Desarrolla con facilidad resistencia secundaria a los azoles, y en especial al fluconazol, por lo que este grupo de antifúngicos no debe utilizarse en su tratamiento. Una excepción pueden ser las infecciones urinarias ya que el fluconazol alcanza una gran concentración en la orina.
Utilización industrial
Se ha utilizado como un agente biosurfactante.
Bioseguridad: Nivel 2
Esta especie se puede manejar en un laboratorio que cumpla las normas de biocontención del nivel 2.

Candida parapsilosis

Género y especie
En base al análisis molecular, el complejo Candida parapsilosis se divide en 3 especies
•         C. parapsilosis: 92% de los aislados
•         C. orthopsilosis: 6% de los aislados
•         C. metapsilosis: 2% de los aislados

(van Asbeck et al (2009)).

Teleomorfo
No tiene.
Hábitat natural
Insectos, suelo, animales domésticos, ambientes marinos. Es un comensal que forma parte del microbioma humano. Se aísla de las mucosas, piel y uñas. Se encuentra con frecuencia en las superficies del hospital.
Distribución geográfica
Mundial.
Frecuencia
Varía dependiendo de la localización geográfica. Ocasiona entre el 12-20% de las candidemias lo que la convierte en la segunda o la tercera especie mas frecuente (dependiendo de la localización geográfica). 
Enfermedades
Candidosis invasora, generalmente en pacientes sin inmunocompromiso. Infecciones del catéter ya que produce biopelículas. Se asocia con una estancia hospitalaria prolongada. Es poco frecuente en vaginitis y otras infecciones de las mucosas. Puede causar también, infección del tracto urinario, endocarditis, peritonitis, artritis y meningitis. En contraste con Candida albicans, muy rara vez causa endoftalmitis.
Peculiaridades del cultivo
Colonias rosas en el Chrom agar. En Sabouraud o agar sangre es blanca o crema y de superficie lisa.
Resistencia a los antifúngicos (intrínseca y adquirida)
En general es completamente sensible a todos los antifúngicos. Candida parapsilosis es mas resistente a la caspofungina, micafungina y anidulafungina pero no las otras dos especies del grupo. En ocasiones adquieren resistencia secundaria a los azoles.  La formación de biopelículas es un factor significativo de la resistencia a los antifúngicos. La anfotericina puede no ser fungicida con esta especie.
Bioseguridad: Nivel 2
Esta especie se puede manejar en un laboratorio que cumpla las normas de biocontención del nivel 2.
Utilización industrial
Biosíntesis de alcoholes quirales y producción de xilitol y xilulosa

Candida tropicalis

Género y Especie
Candida tropicalis
Teleomorfo: No tiene
Hábitat natural
Se encuentra en ambientes marinos, especialmente tropicales y subtropicales y así representa el 4% de todas las levaduras que se aíslan del agua de mar, sedimentos marinos, marismas, intestino de peces, manglares, algas y gambas. También se encuentra en diversas frutas, heces (lo que sugiere que puede colonizar el intestino humano o está presente en alimentos) y suelo.
Distribución geográfica
Mundial pero es una causa mucho más frecuente de candidemia en zonas tropicales y subtropicales.
Frecuencia
Causa candidemia con mas frecuencia en pacientes ingresados en UCIs o que están neutropénicos (hasta el 30% en algunos estudios). Causa poco frecuente de vaginitis o candidosis orofaríngea. Puede causar infección diseminada y profunda.
Enfermedades
Causa candidemia y con menor frecuencia candidosis profunda y diseminada. No suele producir biopelículas. Rara vez ocasiona vaginitis o candidosis orofaríngea. Suele ser más patógena que Candida albicans.
Peculiaridades del cultivo
En Agar Sabouraud o agar patata dextrosa las colonias son de color crema, hueso, grisáceas, apagadas, lisas, blandas y cremosas o arrugadas y rugosas. Por el aspecto de la colonia no se pueden distinguir de otras especies pero no producen clamidosporas terminales. Varis pruebas bioquímicas las diferencian de otras especies de levaduras.
Resistencia a los antifúngicos (intrínseca y adquirida)
En general son sensibles a todos los antifúngicos disponibles. En ocasiones desarrollan resistencia secundaria a los azoles. Es más rara la resistencia a las equinocandinas y a la anfotericina B.
Bioseguridad: Nivel 2
Esta especie se puede manejar en un laboratorio que cumpla las normas de biocontención del nivel 2.
Utilización industrial
Tienen un uso potencia para la producción de ácidos dicarboxílicos de cadena larga y xilitol. Bioabsorción de cadmio y cobre.
Infección pulmonar por Candida tropicalis en un paciente con candidosis diseminada

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